故事設定在怪獸最常出沒的日本。一心想進入防衛隊殺光怪獸的日比野卡夫卡，已經從熱血青年變成30歲的大叔，卻依舊沒能被防衛隊錄取，只能擔任分解怪獸屍體與各項善後工作的清潔隊員，本想放棄希望的卡夫卡在經歷一次意外後，成為擁有強大變身力量的「怪獸8號」。

在學弟市川雷諾的激勵下，卡夫卡隱藏自己的怪獸身分並通過防衛隊的選拔試驗，在實戰中，卡夫卡以豐富的怪獸解剖知識，證明自己在戰鬥中的價值，獲得長官與隊友們的信任。當他還在為隱瞞怪獸身分感到忐忑不安時，一頭高度智慧的怪獸突襲防衛隊基地，面對近乎全面潰敗的頹勢，卡夫卡再無退路，選擇正面迎戰！

而同場加映的《保科特休日》故事則是以市川雷諾與伊春的角度出發，向來埋首訓練或與怪獸作殊死戰的雷諾與伊春，早已忘記假日該如何渡過的兩人決定跟蹤同樣輪休的保科副隊長，卻驚訝地發現他不為人知的一面！