一名嫌疑犯在東城警署羈押倉內離奇消失，探員計子默（古天樂 飾）奮力搜索，依然零線索、零頭緒。百思莫解之際，他突然接到搭檔陽作（此沙 飾）的消息，告知逃犯在警務處總部檔案庫之中。反鎖的倉庫裡，犯人竟然胸膛中槍當場斃命。
犯人究竟如何從牢房逃脫到總部的檔案庫，從一個密室抵達另一個密室？總部專家確認奪命的子彈，源自計子默的警槍，他因而成為最大嫌疑犯。再加上態度不明的大探長司寇宮（任達華 飾）和情報局人員畢書堂（謝君豪 飾）全都捲入謎團中，為案件再添變數，而犯人死因詭譎，背景錯綜複雜，計子默不得不迎戰敵我難分的辣手奇案好自證清白。