劇場版的豪華聲優陣容包括令人熟悉的高山南（飾 亂太郎）、田中真弓（飾 霧丸）、一龍齋貞友（飾 新兵衛），關俊彥（飾 土井半助）等，原班人馬傾力出演。消息一出，就受到粉絲們的高度期待。

《劇場版 忍者亂太郎 毒竹忍者隊最強之軍師》的故事以緊張刺激的情節展開；土井老師在與黃昏時忍者諸泉尊奈門的對決後失蹤下落不明，山田老師和六年級生們隨即展開全面搜尋。

然而，因土井老師的缺席，校長竟是找來黃昏時軍首領─雜渡昆奈門和諸泉尊奈門來擔任一年葉組的代課老師，讓這群忍蛋們狀況百出。同時，忍術學園的死對頭毒竹城私底下蠢蠢欲動，準備對周圍領地開戰，局勢頓時陷入一場大混亂。

霧丸無意間發現土井老師的所在線索，而毒竹忍者隊中的冷酷天才軍師「天鬼」也在此時突如其來現身阻擾，令人震驚的是，天鬼的長相竟與土井老師一模一樣！面對強敵在前，忍蛋們必須團結一致，發揮彼此間的深厚羈絆，才能克服這場前所未有的考驗。亂太郎、霧丸，新兵衛究竟能不能成功把土井老師找回來？

《劇場版 忍者亂太郎 毒竹忍者隊最強之軍師》將於1月29日農曆賀歲檔上映，與你在戲院不見不散！