值得一提的是，卡拉瓦喬向來藉對真人的描繪，來完成他宗教畫作。但此舉引發兩極評價，有人讚嘆畫作逼真、動人心魄，也有人嗆其畫作將盜賊、妓女、乞丐等入畫，神化為聖人、聖母，玷辱了宗教的神聖。其中最經典而震撼的是，卡拉瓦喬用溺死的妓女屍體充當模特兒，所繪出的《聖母之死》（Death of Virgin）即嚴重地挑釁了羅馬教廷。這雖讓他被認為是邪惡的魔鬼、狂妄叛逆；卻同時也是悲憫的天使，關懷卑微民眾最真實的生命力。

1610年，卡拉瓦喬在死罪獲得赦免後，重回到那不勒斯，卻傳聞在路上病亡。由於從沒人看過他的屍體，謎樣的他就這樣從此人間蒸發，年僅39歲。這位才華橫溢的畫家，在世時名聞遐邇，死後卻被人們完全遺忘，一直到20世紀後期才重新被世人發現。